Les 480 hectares du vignoble de Schaffhouse sont divisés en 5 régions :
Klettgau qui se trouve sur un plateau et englobe les communes de Hallau, Oberhallau. Trasadingen, Gächlingen et Osterfingen (env. 150 ha)
Schaffouse (ville), au pied de la fameuse tour du Munot et les communes de Thayngen, Dörflingen, Bibern
Oberklettgau avec les communes de Siblingen, Löhningen, Schleitheim, Beringen
Stein - am - Rhein, proche de la cité médiévale
Buchberg et Rüdlingen au bord du Rhin au sud du canton
Climat
Le vignoble de Schaffhouse est probablement le vignoble de Suisse orientale qui reçoit le moins de pluie. Le climat est septentrional et la proximité du Rhin influence également le temps.
Sols
Les sols du vignoble sont à majorité mollassiques.